1、两者概念不同。

不征税收入指本来就不属于企业所得税的征收范围、不作为应纳税所得的收入；而免税收入则指属于企业所得税的征收范围但依据规定免予征收企业所得税的收入。

不征税不属于税收优惠政策，而免税则属于税收优惠政策。

2、收入对应成本费用税前扣除政策不同。

不征税收入用于支出所形成的费用不得在企业所得税前扣除；形成的资产，其折旧或推销不得在企业所得税扣除。而企业取得免税收入对应的各项成本费用支出，在企业所得税汇算时可以扣除，减少当期应纳税所得额。

3、包括的收入范围不同。

不征税收入包括符合条件的财政拨款、依法收取并纳入财政管理的行政事业性收费、政府性基金及国务院规定的其他不征税收入；免税收入包括国债利息收入、符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资收益、在中国境内设立机构、场所的非居民企业从居民企业取得与该机构、场所有实际联系的股息、红利等权益性投资收益及其他符合条件的非营利组织的收入。